Google大脑与药物研究组织合作,以电脑视觉发现关键蛋白质晶体加速药物开发
2018-07-16 11:14:26 | 来源:ithome | 投稿:米阳 | 编辑:dations

原标题:Google大脑与药物研究组织合作,以电脑视觉发现关键蛋白质晶体加速药物开发

Google大脑与MARCO倡议组织共同合作,以电脑视觉找出重要的蛋白质晶体加速新药开发。虽然这些蛋白质的实验配置以及成像都是自动化的,但是分辨蛋白质晶体的工作仍然落在人类身上,也由于这些蛋白质可能非常的稀少微小,人类分辨的正确率成为了蛋白质实验的瓶颈,通过电脑的帮忙,可以更快更正确地找出这些蛋白质晶体。

MARCO倡议组织首席研究员Patrick△Charbonneau表示,每次错过的蛋白质结晶,都代表错失重要生物医学发现的可能性,因为这些结晶非常罕见。

由于蛋白质结晶是生物医学,研究复杂生物分子结构的关键步骤,这些结构决定着分子的功能,科学家能用于开发新药。但是这些蛋白质结晶很少见也很难找到,实验室通常都会对每一种蛋白质进行上百次的实验,配置以及成像的过程都是自动化的,但是发现单个结晶的过程却需要通过目视过程,人为错误无可避免,不过这些错误却可能错失重要的生物医学发现。

由于成像技术以及资料采集方法非常多种,晶体可能在很大的影像中显得非常微小,这些因素都使得分辨工作变得困难。Google大脑与MARCO倡议组织研究人员合作,他们使用深度卷积网络架构,应用电脑视觉分辨蛋白质晶体,让正确率高达94%。研究人员提到,现代深度卷积网络非常适合处理外观极端变化的视觉图像,他们修改了基本的Inception△V3模型,使其能够更快地处理更大的图像。

MARCO倡议组织是数间制药公司以及学术单位组成的研究计划,目的在汇集和托管大型策划的晶体学图像,以帮助开发出更好的图像分析工具,而Google大脑与MARCO合作的研究资料集,便是使用该组织内的50万张标记图像。为促进这领域的发展,他们决定释出实验资料集,并开源TensorFlow研究模型储存库。

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